Да, лучше всего было поместить трубу дренажной системы в слое щебня. Необходимо переустроить дренажную систему, поскольку слой песка быстро заилится, и она перестанет работать.
Кроме того, желательно и сам щебень поместить в слое геотекстиля, тогда дренажная система прослужит дольше.